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親子鑒定原理：孟德爾遺傳學。子女的基因型一半來自母親，另一半來自父親。一般檢測出來的DNA數據是以數字的形式體現，表示的是堿基重復數，且每一個基因座位點有兩個數字，如果是相同的數字表示純合子，不同的表示的是雜合子。對比兩者的DNA數據，在同一基因位點有完全相同的數字的話表示子代的遺傳基因能從親代中找到來源，符合孟德爾遺傳規律。
親子鑒定否定的：三個以上位點不符合遺傳規律的不支持兩者存在親子鑒定關系。即非親生的。可以對比兩者間同一基因座位點的兩組數字，完全不相同的基因座位點現象有多個（三個以上）。
親子鑒定肯定的：所以位點符合遺傳規律且累積父權指數大于或等于10000。即親生的。比對兩者間同一基因座位點的兩組數字，每一個基因座位點至少有一個數字是完全相同的。
親子鑒定突變現象：三個或三個以內的位點不符合遺傳規律的，被認為是基因突變現象產生的。需要做父母子三聯體的親子鑒定或父子兩人同時增加檢測到40位點來判定親子關系。

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