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盡管是醫學專業出身，但當鄧亞軍真正加人到國際人類基因組計劃之后，才發現自己在基因領域完全像個小白鼠。為了盡快縮短與其他人的差距，她采取了慣用的笨辦法一一邊干活邊學習，每天一有時間就抱著基因方面的教材，來北京很長時間都一直待在順義，連城門朝哪兒開都不知道。

不過就靠著這個笨辦法，鄧亞軍很快趕了上來。2000年12月，鄧亞軍開始擔任生產測序部總調度一一說白了就是給生產線上的每個人安排活兒，同時監控流程進度。由于工作認真出色，2001年7月她又被任命為生產測序部主管。

與此同時，由華大基因研究中心承擔了85%工作量的國際人類基因組計劃1%項目也取得了重大進展: 2000年6月 中國方面與國際同行共同發布人類基因組工作框架圖j2001年2月， 國際人類基因組計劃在《自然》雜志上發表《人類基因組:初步測序及分析》論文，其中包括華大主要負責的1%項目j 2001年8月，國際人類基因組計劃 1%項目通過了由科技部和中國 科學院聯合組織的專家驗收，而比當時國際協調組給中國預期的完成時間，足足提前了兩年!